Jätevesiseuranta on noussut uudeksi epidemiatyökaluksi tartuntatautien seurannassa, koska sen avulla voidaan havaita väestötasolla tapahtuvia muutoksia. Uuden sukupolven sekvensointitekniikoiden nopea kehittyminen on laskenut sekvensoinnin kustannuksia, mikä puolestaan tukee projekteja, joissa tutkitaan näytteen kaikki geneettinen materiaali (metagenomit). Tässä hankkeessa tutkimme jäteveden metagenomia, koska sen avulla saamme luotettavan kuvan väestön terveyteen vaikuttavista tekijöistä viemäriverkoston alueella. Arvioimme jäteveden geneettisten tekijöiden ja paikkakuntakohtaisten terveystietojen välisiä tilastollisia riippuvuuksia. Käytämme näiden geneettisten tautiriski-indikaattorien tunnistamiseen bioinformatiikan ja datatieteen menetelmiä, esimerkiksi koneoppimista. Lisäksi tutkimus tuottaa kustannustehokkaan menetelmän infektioepidemiologisen terveystiedon tuottamiselle ja väestön terveystutkimukselle.
Muualla verkossa ja lisätietoja
Ympäristöterveyden tutkimusryhmä, Lääketieteen ja terveysteknologian tiedekunta, Tampereen yliopisto, TAU
Projekti MiWaGen THL:n verkkosivuilla (thl.fi)
Hyvinvointivaikuttajat (thl.fi)
Terveyden ja hyvinvoinnin laitos, THL
Uutiset
Uusia akatemiahankkeita biotieteiden, terveyden ja ympäristön tutkimukseen